Pacientams, turintiems sunkių simptomų, kurie nereaguoja į kitus gydymo būdus, gali būti pasirinkta operacija. Chirurgijos tikslas – pagerinti šlapimo pūslės talpą ir sumažinti vidinį šlapimo pūslės spaudimą, tačiau ji nelabai veiksmingai malšina šlapimo pūslės skausmą.
Šlapimo pūslės padidėjimas: Žarnos segmentas nuimamas ir susiuvamas prie šlapimo pūslės, kad padidėtų jos talpa. Po šios procedūros gali prireikti visą gyvenimą trunkančio kateterizavimo.
Cistektomija ir šlapimo nukreipimas: susitraukusi šlapimo pūslė pašalinama chirurginiu būdu; paimamas žarnyno segmentas, kad būtų sukurta šlapimo pūslė, kuri vėliau naudojama pilvo sienelės stomai sukurti, kad nutekėtų šlapimas.